Após completar a formação no Londrina, Welton Junior ainda representou clubes como Prudentópolis, Paranaense e Remo, antes de rumar ao velho continente.
As suas duas primeiras épocas na Europa (2019/2020 e 2020/2021) foram no Berço SC, disputando, assim, o Campeonato de Portugal. Em 2021/2022 saltou para a Liga 3, onde vestiu as cores do Vitória SC B, e na temporada seguinte destacou-se ao serviço do FC Felgueiras – também do terceiro escalão do futebol português.
Pelos felgueirenses, Welton Junior fez 29 jogos, marcou nove golos e assistiu para outros quatro – números e exibições que lhe valeram um lugar na Equipa do Ano da Liga 3 2022/2023.
Welton Junior assinou com o FC Paços de Ferreira no mercado de verão de 2023. Na sua época de estreia na Capital do Móvel, fez 32 jogos, apontou dois golos e somou cinco assistências.
